南京公司注册小微企业优惠政策相关规定---《国家税务总局关于小微企业免征增值税和营业税有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第57号）第二条规定，增值税小规模纳税人兼营营业税应税项目的，应当分别核算增值税应税项目的销售额和营业税应税项目的营业额，南京注册公司的企业月销售额不超过3万元（按季纳税9万元）的，免征增值税；月营业额不超过3万元（按季纳税9万元）的，免征营业税。
《财政部、国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）附件1第一条规定，在中华人民共和国境内销售服务、无形资产或者不动产的单位和个人，为增值税纳税人，应当按照本办法缴纳增值税，不缴纳营业税。
营改增后，只有增值税纳税人而没有营业税纳税人，只有货物及劳务和应税行为销售额而没有营业额，营改增的精神是基本平移原营业税政策规定，免征增值税货物销售额和应税行为的销售额应当分别核算。
例：某增值税小规模纳税人2016年5月10日成立，2016年第2季度销售货物收入为6万元，提供技术服务收入为4万元，该纳税人如何填报季度纳税申报表？按小微企业减免增值税申报还是按3%的征收率申报缴纳增值税？
从会计利润表上来看，本季度营业收入合计为10万元（6+4），不能享受季度销售额不超过9万元免征增值税的规定，因此，该小规模纳税人第2季度应缴纳增值税3000元（100000×3%）。这样的做法是错误的。
正确的做法是：货物及劳务销售额、销售服务、不动产和无形资产销售额分别计算增值税，销售货物收入为6万元，提供技术服务收入为4万元，各自享受季度销售额不超过9万元免征增值税的规定。
在填报《增值税纳税申报表》时，在第9栏“（四）免税销售额”：本期销售货物及劳务为60000元，本期销售服务、不动产和无形资产为40000元；第10栏“其中：小微企业免税销售额”：本期销售货物及劳务为60000元，本期销售服务、不动产和无形资产为40000元；第17栏“本期免税额”：本期销售货物及劳务为1800元，本期销售服务、不动产和无形资产为1200元。第18栏“其中：小微企业免税额”：本期销售货物及劳务为1800元，本期销售服务、不动产和无形资产为1200元。第15栏“本期应纳税额”：本期销售货物及劳务为0元，本期销售服务、不动产和无形资产为0元。